深圳基因測序貢獻超全球五成
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截至今年12月初,華大基因已經在《自然》、《科學》等頂級學術雜誌上發表了160多篇高水平論文。
僅僅用了15年的時間,深圳企業華大基因就從支持1%人類基因組計劃到成長爲爲世界基因測序貢獻超過50%的企業。
2009年以來,深圳陸續將生物產業、生命健康產業分別作爲戰略性新興產業和未來產業重點培育和支持,而到2013年深圳的生物產業規模就突破了1000億元,其基因測序的產出能力佔了全球50%以上,並擁有全國唯一的國家基因庫,集聚了華大基因、袁隆平院士團隊、邁瑞、海普瑞等一批高層次的團隊和知名企業。
華大基因研究院院長兼CEO王俊日前接受南方日報採訪時稱,作爲全球規模最大、技術領先的基因組學研究機構,華大基因的研究和臨牀應用將使得普通人也能負擔起基因檢測的費用,未來有望藉助這個方法增進健康、延長壽命。據其介紹,目前個人全基因組測序價格接近上萬元,而明年將降低至幾千元,華大基因正在計劃推出相關新產品。
構建“數據王國”,打造“生物版谷歌”
1999年,華大基因支持了人類基因組計劃的1%,而近年來,華大基因的基因測序能力則讓其在世界基因測序上的貢獻超出了50%。當1999年成立的華大基因2007年遷至深圳時,它被形容爲“裸奔”而來。如今,華大基因5000餘名員工分佈在世界各地,平均年齡僅27歲。位於深圳鹽田區北山工業區的華大基因總部,前身是一箇舊鞋廠,而2017年將啓用的、位於深圳大梅沙的華大基因中心,將更能體現其在國際生物領域的領先地位。
2010年,華大基因購入了128臺世界上最先進的DNA測序儀器,當時每臺市場報價約70萬美元。2013年底,華大坐擁178臺不同品牌的測序儀,每年可實現5萬人的基因組測序,數據生產規模達到近5PB,輸出的數據量約佔全球基因組數據總量的50%。
在外界看來,早期的華大基因似乎像是一個巨型數據生產機,甚至被不少人誤認爲是“生物領域的富士康”,但華大基因對海量生物信息數據的處理、分析和解讀能力,是其躋身國際基因組領域一流研究機構的關鍵要素,這種優勢使其越來越難以複製和替代。自1999年成立以來就一直很重視大數據的華大基因,正在構建一個“數據王國”,提出打造“生物版谷歌”的未來暢想,對於生物技術與大數據碰撞的前景表示樂觀。
生物技術是全球繼信息技術之後發展速度最快、發展潛力和空間最大的產業,也是將會在未來幾十年對全球經濟影響最深刻的產業,以基因組學爲代表的前沿的生物技術推動着人類對生命世界的認識水平發生質的飛躍。全球頂尖科研機構和企業都通過與華大基因的合作來強化自身在組學領域的能力,加速自身的研發進度,以便將相關科學發現、新技術更快地推向產業化。
2014年12月12日,華大基因、深圳國家基因庫、《科學》雜誌等聯合發佈了中外200餘位科學家共同完成的鳥類基因組系統演化史項目重大成果,當天,在《科學》和其他雜誌上以專刊形式集中公佈了28篇首期研究成果,這些成果中有8篇刊登在《科學》鳥類專刊上,其餘20篇將陸續刊登在GenomeBiology等雜誌上。這也是國內機構首次以專刊的形式在《科學》雜誌上發表如此多的研究成果。
深圳市市長許勤在12日的發佈會上評價,華大基因的成就影響着全球的生物技術和生物產業的發展。他表示:“以基因組學爲代表的前沿的生物技術推動着人類對生命世界的認識水平發生質的飛躍,我們認識客觀世界最後來認識自身,是一個國家和地區生物技術發展水平的集中體現”。
華大基因創始人之一、董事長汪建稱,科學界特別是民間科學界、民營的科學家也能在深圳創造出影響世界發展的奇蹟,做出引領型的創新,相信我國未來的創新也能夠從“追趕型”更多地向“引領型”轉變。
華大基因的重點研究方向包括人類健康、動植物基因組、微生物基因組等。從創立初期的人類基因組測序計劃,到2003年破譯SARS病毒基因組序列,到研製出埃博拉病毒核酸檢測試劑,華大基因顛覆了主流科研單位的實驗室模式,用工業化的組織方法來實現大數據採集,將BT與IT高度結合。截至今年12月初,華大基因已經在《自然》、《科學》等頂級學術雜誌上發表了160多篇高水平論文。
明年華大測序成本將大幅降低
在研究成果層出不窮的同時,華大基因在產業化方面也取得了很多進展,旗下的華大科技、華大醫學、華大農業、華大製造等機構在各個領域不斷開拓。
2013年3月,華大基因通過旗下子公司併購了美國納斯達克上市公司CompleteGenomics(簡稱“CG”),CG讓華大基因有了自己的“軍工廠”,不再依賴進口測序儀器。面對即將“爆發”的基因測序市場,華大基因可以大規模生產各種測序儀器。
王俊近日告訴記者,華大基因收購CG後,已經完全把測序的平臺自主化、國產化,在此基礎之上使得測序成本超摩爾定律的發展應用在基因組學領域,15年前做一個人類基因組需要花費30億美金,現在已經接近上萬,明年又可以再降低,幾千元就可以做一個人的全部基因組。
“我們不是以盈利爲目的的機構,也不是以發表文章爲目的的機構,我們就是想用基因組的平臺和技術,最終做點老百姓能受用的事。”王俊曾告訴記者,華大所有的研究都是從民生應用開始思考,研究沿着產業鏈逆流而上,每一項研究領域如農業、生育健康、腫瘤、慢性病等都有從科研到產業化的完整鏈條。
在醫學方面,以基因測序領域最廣爲人知的、針對唐氏綜合徵篩查的無創產前基因檢測爲例,截至12月初,華大基因已在全球範圍內做了40萬例無創產前基因檢測。隨着多種基因檢測項目的增加,華大醫學的業務預計會有很大的發展空間和上升潛力。
在農業育種方面,華大基因計劃建立世界領先的基因分型平臺、基因挖掘平臺和全基因組分子育種技術平臺,其中開放的育種平臺將向大中小企業開放,基於該平臺,中小型公司投入一兩百萬元甚至幾十萬元,就可以在兩三年內確保實現一個動物或植物品種的改良,有利於保障農業生態的安全。
作爲華大基因旗下最年輕的機構,華大製造過去近一年時間裏建立了深圳、武漢兩地的儀器和試劑生產車間、質量管理體系。2014年7月,華大製造的第一個系列產品——兩款測序儀及配套的胎兒染色體非整倍體檢測試劑盒,獲得了CFDA醫療器械註冊證,這是全球首個獲批的真正意義上的高通量測序臨牀應用產品。
■數字
96個疾病位點
華大基因旗下的華大科技今年11月起啓動了寵物基因檢測項目,主要針對寵物狗單基因遺傳病進行檢測,範圍涉及到視力、腎臟、骨骼、神經、皮膚等方面的。隨着技術的成熟,華大科技後續將推出寵物狗品種鑑定、育種指導等服務,同時也會開發其他寵物(貓,鳥)的基因檢測項目。
100萬英鎊
華大基因今年7月與英國愛丁堡大學簽署合作協議,雙方將攜手推動人工合成酵母基因組研究的突破,開展高達100萬英鎊的人工合成生物學項目,在EdinburghGenomeFoundry進行酵母七號染色體合成。酵母七號染色體基因組合成的成果將廣泛應用於化工生產、能源和糧食領域,以維持和改善人類健康和環境。
1267個人體
腸道微生物樣本
華大基因研究院等多家單位的科研人員今年7月聯合發表了迄今爲止最具代表性、最高質量、近乎完整的人類腸道微生物參考基因集數據庫,研究成果在國際期刊《自然生物技術》在線發表。
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